Universitas Negeri Yogyakarta terus berupaya untuk mengembangkan bidang penelitian dan pemberdayaan masyarakat. Untuk itu UNY mendorong seluruh prodi yang ada di UNY untuk bisa melangkah jauh lagi dalam memperoleh akreditasi internasional. Salah satu akreditasi internasional yang kini tengah dilakukan oleh FMIPA UNY yakni akreditasi ASIIN (Accreditation Agency for Degree Programs in Engineering, Informatics/Computer Science, The Natural Sciences and Mathematics). Ada 3 prodi yang mengajukan akreditasi ASIIN yaitu Fisika S1, Pendidikan Fisika S1, dan Statistika S1.

FMIPA Universitas Negeri Yogyakarta khususnya Departemen Pendidikan Fisika menjalin kerjasama dengan School of Education, Faculty of Social Sciences and Humanities, Universiti Teknologi Malaysia yang diwakili oleh Dr. Noorzana Khamis. Penandatanganan tentang guest lecturer dilaksanakan Selasa, 28/5/24 di ruang sidang FMIPA. Selama beberapa hari Dr. Noorzana Khamis memberikan materi kepada mahasiswa tentang model pembelajaran, penilaian, dan penelitian dalam pendidikan fisika

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Yogyakarta (FMIPA UNY) menjalin kerjasama dengan Fakultas Pertanian Universitas Udayana Bali. Penandatanganan naskah kerjasama dilaksanakan, Kamis, 16/6/24 diruang siding FMIPA UNY. Kerjasama kedua belah pihak yaitu tentang program penelitian bersama tentang Penyelamatan dan Pengembangan Anggrek Varietas Baru Forma Bali

FMIPA Universitas Negeri Yogyakarta menjalin kerjasama dibidang pendidikan dengan salah satu universitas di Korea Selatan yaitu Universitas Kyonggi.  Hadir dari Universitas Kyonggi adalah Dr. Ravindran Balasubramani. Pertemuan dilaksanakan Jumat, 19/4/24 diruang sidang fakultas. Hadir pada kesempatan tersebut Dr. Tien Aminatun, Wakil Dekan bidang Riset, Kerjasama, Sistem Informasi, dan Usaha, para pengurus dan dosen Departemen Pendidikan Kimia, dan UUIK FMIPA.